192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2799 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
168 aa  347  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.32 
 
 
167 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.75 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.37 
 
 
164 aa  124  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2579  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.89 
 
 
167 aa  121  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.4 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  38.27 
 
 
175 aa  118  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3078  Phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 
167 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800804 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.88 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.02 
 
 
166 aa  111  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2814  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.36 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  35.4 
 
 
166 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 
166 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0656  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.25 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0915  phosphohistidine phosphatase SixA  31.25 
 
 
159 aa  94  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  31.68 
 
 
159 aa  91.3  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1478  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 
179 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.924383  normal  0.612523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.79 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.63 
 
 
161 aa  85.9  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17830  phosphoglycerate mutase family protein  32.88 
 
 
160 aa  84.3  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1082  phosphohistidine phosphatase SixA  29.76 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.396252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.48 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.51 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  29.76 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  29.76 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4627  phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.026372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.91 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3058  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.46 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.59 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11918  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.06 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298677  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.19 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.43 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4118  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.99 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0361837  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1088  phosphoglycerate mutase family protein  30.63 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1113  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.75 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0733  phosphohistidine phosphatase SixA, putative  24.38 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00220786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4461  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.48 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4536  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.99 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  28.75 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.16 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0631  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.33 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.84 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.09 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0881  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.5 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00451478  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1896  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.61 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2363  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.9 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822646  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  30.19 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1094  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.42 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.175026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.1 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0659  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  23.81 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.72 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.62 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5540  hypothetical protein  23.84 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.91 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0059  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.89 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0689048  hitchhiker  0.00895006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.14 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0806  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  23.21 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.15 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.25 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2320  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.26 
 
 
182 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.825769  normal  0.76256 
 
 
-
 
NC_004310  BR1035  hypothetical protein  34.45 
 
 
166 aa  61.6  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  30 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3559  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.09 
 
 
188 aa  61.6  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1965  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.17 
 
 
164 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590219  normal  0.236004 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.21 
 
 
153 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.78 
 
 
158 aa  61.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.19 
 
 
164 aa  60.8  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2469  hypothetical protein  30.51 
 
 
166 aa  60.8  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.47 
 
 
157 aa  60.8  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  27.45 
 
 
169 aa  60.5  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.21 
 
 
153 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.21 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.06 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.21 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.12 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0224  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.56 
 
 
154 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0935  phosphoglycerate mutase family protein  25.88 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1328  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.68 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.48 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4984  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.01 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277019  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2309  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.06 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2731  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.9 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542354  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0539  phosphohistidine phosphatase  27.16 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2863  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.04 
 
 
168 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2177  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.5 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210616  hitchhiker  0.00370879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0299  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  23.67 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0426  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  23.53 
 
 
185 aa  57.4  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.407898  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1480  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.84 
 
 
185 aa  57.4  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.474903  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.55 
 
 
169 aa  57.4  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1070  hypothetical protein  26.32 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  28.87 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2121  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88488  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.71 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.38 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0892  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.82 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  27.15 
 
 
218 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3504  Phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4278  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.92 
 
 
175 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>