236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2415 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
164 aa  347  3e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  62.2 
 
 
164 aa  223  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2814  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  58.28 
 
 
164 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2579  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  57.93 
 
 
167 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  54.32 
 
 
163 aa  198  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  50.62 
 
 
166 aa  174  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.46 
 
 
164 aa  149  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  42.94 
 
 
166 aa  145  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  39.26 
 
 
166 aa  137  8.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0656  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.02 
 
 
166 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3078  Phosphoglycerate mutase  41.88 
 
 
167 aa  134  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.37 
 
 
168 aa  124  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  37.5 
 
 
175 aa  120  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  35.58 
 
 
159 aa  114  6e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17830  phosphoglycerate mutase family protein  37.27 
 
 
160 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0915  phosphohistidine phosphatase SixA  33.13 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.87 
 
 
167 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4536  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.19 
 
 
161 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1088  phosphoglycerate mutase family protein  35.15 
 
 
164 aa  100  8e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11918  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.4 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298677  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  32.73 
 
 
165 aa  94  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2363  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.56 
 
 
181 aa  90.5  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822646  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1082  phosphohistidine phosphatase SixA  29.01 
 
 
170 aa  88.2  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.396252  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.32 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0420661  normal  0.240897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4627  phosphoglycerate mutase  29.24 
 
 
176 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.026372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.24 
 
 
176 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  30.19 
 
 
170 aa  87  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  29.63 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0733  phosphohistidine phosphatase SixA, putative  30.49 
 
 
163 aa  84.3  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00220786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.36 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.18 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3058  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.59 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0426  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.59 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.407898  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3559  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.41 
 
 
188 aa  82  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.07 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.33 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1113  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.99 
 
 
174 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.86 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4118  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.24 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0361837  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.19 
 
 
445 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.59 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1478  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.24 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.924383  normal  0.612523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2177  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210616  hitchhiker  0.00370879 
 
 
-
 
NC_004310  BR1035  hypothetical protein  35.59 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0881  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.5 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00451478  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1965  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.33 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590219  normal  0.236004 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2121  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.87 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4461  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.41 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0806  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.71 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0498  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.78 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1896  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.19 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0659  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.29 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2469  hypothetical protein  30.33 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1528  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.08 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1094  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.29 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.175026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3504  Phosphoglycerate mutase  26.54 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107092  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1070  hypothetical protein  27.81 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0299  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.9 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2731  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.81 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542354  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2863  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.49 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0322  putative phosphatase  31.15 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.629623  normal  0.448063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0501  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.42 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.71 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.773586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.97 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5540  hypothetical protein  26.47 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.82 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  31.45 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.87 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
225 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.23 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2309  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.82 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4984  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.82 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277019  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.48 
 
 
160 aa  58.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  31.48 
 
 
160 aa  58.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.42 
 
 
158 aa  57.8  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0059  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.43 
 
 
185 aa  57.4  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0689048  hitchhiker  0.00895006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1480  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.48 
 
 
185 aa  57.4  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.474903  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0780  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  29.03 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  27.81 
 
 
439 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2320  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.13 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.825769  normal  0.76256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0631  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.75 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1730  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.15 
 
 
172 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.81 
 
 
169 aa  54.7  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2573  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
194 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370577  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.38 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0935  phosphoglycerate mutase family protein  28.37 
 
 
185 aa  54.7  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0224  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.4 
 
 
154 aa  54.3  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1328  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.44 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.19 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0209  phosphoglycerate mutase family protein  41.33 
 
 
189 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0091  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.15 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21760  phosphohistidine phosphatase SixA  24.54 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  44.12 
 
 
209 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03360  phosphohistidine phosphatase SixA  28.45 
 
 
174 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 
208 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  44.62 
 
 
209 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>