140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0935 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0935  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
185 aa  379  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0539  phosphohistidine phosphatase  50.54 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.65 
 
 
171 aa  104  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.773586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21760  phosphohistidine phosphatase SixA  36.94 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.32 
 
 
171 aa  82  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 
157 aa  82  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  30.83 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1688  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.77 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2320  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.02 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.825769  normal  0.76256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4437  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.99 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0979353  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3936  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.76 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4010  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.76 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.461298  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0659  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.97 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  31.36 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0806  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.32 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0501  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.41 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3951  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.76 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0128792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.67 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.4 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2309  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.54 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0426  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.25 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.407898  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03360  phosphohistidine phosphatase SixA  29.34 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15890  phosphohistidine phosphatase SixA  31.47 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0507958  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4970  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.88 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  26.95 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.26 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0780  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.9 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.25 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.79 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.93 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.37 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.59 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2121  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.04 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88488  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0386  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.19 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398558  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.25 
 
 
158 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2408  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.15 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1082  phosphohistidine phosphatase SixA  31.09 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.396252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.59 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  30.16 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1035  hypothetical protein  29.86 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0915  phosphohistidine phosphatase SixA  31.62 
 
 
159 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2579  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
167 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11302  hypothetical protein  33.05 
 
 
168 aa  62  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0497  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.29 
 
 
162 aa  61.6  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.316739  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.1 
 
 
174 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1088  phosphoglycerate mutase family protein  28.23 
 
 
164 aa  61.2  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2573  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
194 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370577  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.52 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2254  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.66 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1730  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.06 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4627  phosphoglycerate mutase  27.52 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.026372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.88 
 
 
168 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.03 
 
 
177 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3504  Phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 
165 aa  58.9  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107092  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3906  Phosphoglycerate mutase  32.9 
 
 
170 aa  58.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0631  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.82 
 
 
168 aa  58.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0322  putative phosphatase  34.15 
 
 
166 aa  58.2  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.629623  normal  0.448063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0781  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.7 
 
 
150 aa  58.2  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4984  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.48 
 
 
183 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277019  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.27 
 
 
155 aa  57.8  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.48 
 
 
158 aa  57.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0059  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.41 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0689048  hitchhiker  0.00895006 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2814  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.17 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.54 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1480  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.17 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.474903  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1528  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.33 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  30.25 
 
 
170 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  29.41 
 
 
170 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.1 
 
 
161 aa  55.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  29.93 
 
 
158 aa  55.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.37 
 
 
164 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.48 
 
 
183 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4118  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.81 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0361837  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3521  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.61 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000585332 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.41 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0733  phosphohistidine phosphatase SixA, putative  25 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00220786  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1896  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.41 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  27.5 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.93 
 
 
162 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 
152 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.84 
 
 
156 aa  52  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0656  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.1 
 
 
166 aa  51.6  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.25 
 
 
169 aa  51.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 
153 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4461  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.29 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2177  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.06 
 
 
164 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210616  hitchhiker  0.00370879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.1 
 
 
153 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.03 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.61 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3058  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.45 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2363  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.93 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0498  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.42 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3078  Phosphoglycerate mutase  29.6 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800804 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2377  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.1 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1113  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.52 
 
 
174 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>