162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0780 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0780  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
143 aa  284  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3906  Phosphoglycerate mutase  47.86 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11302  hypothetical protein  45.06 
 
 
168 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0501  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  51.39 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4437  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  47.55 
 
 
172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0979353  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3951  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.37 
 
 
198 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0128792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3936  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.77 
 
 
198 aa  105  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4010  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.77 
 
 
198 aa  105  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.461298  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2254  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.07 
 
 
200 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4970  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  51.89 
 
 
183 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0659  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.86 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0881  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.55 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00451478  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.26 
 
 
175 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3058  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.72 
 
 
185 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0806  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.06 
 
 
175 aa  84  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1113  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.56 
 
 
174 aa  84  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4118  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.62 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0361837  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.55 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4627  phosphoglycerate mutase  42.55 
 
 
176 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.026372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.69 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2363  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.3 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.68 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0498  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.88 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0322  putative phosphatase  36.05 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.629623  normal  0.448063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.64 
 
 
177 aa  73.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.84 
 
 
170 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2863  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.72 
 
 
168 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0386  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.07 
 
 
170 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398558  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  35.07 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0781  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.9 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.06 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1070  hypothetical protein  38.51 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2731  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.51 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542354  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4984  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.15 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277019  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03360  phosphohistidine phosphatase SixA  36.6 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.12 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0420661  normal  0.240897 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  38.41 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4536  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.22 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2309  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.45 
 
 
168 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1688  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.27 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  34.53 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0935  phosphoglycerate mutase family protein  31.9 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  33.87 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.16 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0656  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.87 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  26.28 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0299  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.58 
 
 
165 aa  63.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.17 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.773586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1328  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.77 
 
 
179 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3559  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.56 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1094  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.64 
 
 
183 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.175026 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2320  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40 
 
 
182 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.825769  normal  0.76256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2177  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.43 
 
 
164 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210616  hitchhiker  0.00370879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1965  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.14 
 
 
164 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590219  normal  0.236004 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.69 
 
 
171 aa  60.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21760  phosphohistidine phosphatase SixA  35.66 
 
 
174 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.51 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0088  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.76 
 
 
209 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15890  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0507958  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0915  phosphohistidine phosphatase SixA  27.21 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0426  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.17 
 
 
185 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.407898  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2408  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.64 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1730  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.67 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.26 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3078  Phosphoglycerate mutase  29.93 
 
 
167 aa  57.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800804 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17830  phosphoglycerate mutase family protein  34.27 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0059  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.39 
 
 
185 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0689048  hitchhiker  0.00895006 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11918  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.99 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298677  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0631  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.21 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2469  hypothetical protein  28.45 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.6 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5540  hypothetical protein  36.55 
 
 
175 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0539  phosphohistidine phosphatase  32.48 
 
 
185 aa  54.3  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1480  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.59 
 
 
185 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.474903  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 
166 aa  54.7  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1478  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.11 
 
 
179 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.924383  normal  0.612523 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  23.24 
 
 
165 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3504  Phosphoglycerate mutase  34.06 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.97 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.29 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1528  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.11 
 
 
179 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.51 
 
 
158 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2573  phosphoglycerate mutase  37.32 
 
 
194 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0091  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.45 
 
 
178 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  26.81 
 
 
170 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  26.81 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.97 
 
 
445 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4461  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.93 
 
 
176 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.05 
 
 
164 aa  50.4  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1082  phosphohistidine phosphatase SixA  27.54 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.396252  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1896  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.55 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0497  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.03 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.316739  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2579  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.27 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0393  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.54 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0246884  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 
166 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14439  predicted protein  30.99 
 
 
193 aa  47.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.71 
 
 
161 aa  47.4  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0422  phosphoglycerate mutase 1 family protein  41.18 
 
 
237 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>