133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3058 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3058  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
185 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1113  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  54.02 
 
 
174 aa  168  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  52.38 
 
 
174 aa  167  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4627  phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 
176 aa  165  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.026372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  53.85 
 
 
176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  52.07 
 
 
174 aa  164  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  52.05 
 
 
175 aa  164  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4118  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  48.52 
 
 
173 aa  161  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0361837  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1094  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  45.45 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.175026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5540  hypothetical protein  42.53 
 
 
175 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.15 
 
 
176 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4984  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.71 
 
 
183 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277019  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2309  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.24 
 
 
168 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1478  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.31 
 
 
179 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.924383  normal  0.612523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1328  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.33 
 
 
179 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  41.88 
 
 
157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.42 
 
 
176 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3521  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.57 
 
 
175 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000585332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0881  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.02 
 
 
172 aa  111  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00451478  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3559  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.99 
 
 
188 aa  111  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4461  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.99 
 
 
176 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0426  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.79 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.407898  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0806  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.12 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0659  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 
175 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.77 
 
 
170 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1480  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.37 
 
 
185 aa  104  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.474903  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11302  hypothetical protein  39.88 
 
 
168 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2320  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.43 
 
 
182 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.825769  normal  0.76256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2408  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.43 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21760  phosphohistidine phosphatase SixA  38.46 
 
 
174 aa  99  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0631  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.65 
 
 
168 aa  98.2  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  29.82 
 
 
175 aa  98.2  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0501  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.08 
 
 
181 aa  97.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0386  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.33 
 
 
170 aa  97.4  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398558  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2363  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.71 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822646  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2731  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.09 
 
 
168 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542354  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2121  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.36 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88488  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2863  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.91 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0299  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.09 
 
 
165 aa  95.5  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.09 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0420661  normal  0.240897 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.57 
 
 
171 aa  95.5  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.773586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1070  hypothetical protein  35.5 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.24 
 
 
171 aa  94.4  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3078  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
167 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2579  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.1 
 
 
167 aa  92  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.13 
 
 
183 aa  91.3  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0498  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.74 
 
 
161 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  32.14 
 
 
166 aa  89.4  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.3 
 
 
177 aa  89  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.95 
 
 
164 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4437  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.21 
 
 
172 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0979353  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0656  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.18 
 
 
166 aa  88.2  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03360  phosphohistidine phosphatase SixA  32.14 
 
 
174 aa  87.8  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.98 
 
 
155 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3936  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.71 
 
 
198 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4010  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.71 
 
 
198 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.461298  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3951  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.24 
 
 
198 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0128792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0780  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.72 
 
 
143 aa  85.5  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2573  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370577  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0322  putative phosphatase  34.73 
 
 
166 aa  85.1  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.629623  normal  0.448063 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3504  Phosphoglycerate mutase  34.71 
 
 
165 aa  84.7  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107092  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1896  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.1 
 
 
168 aa  84.3  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.76 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0915  phosphohistidine phosphatase SixA  25.15 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.59 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0059  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.84 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0689048  hitchhiker  0.00895006 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3906  Phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17830  phosphoglycerate mutase family protein  31.76 
 
 
160 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11918  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.89 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298677  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  26.44 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.46 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1730  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.13 
 
 
172 aa  79  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2814  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
164 aa  79  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1082  phosphohistidine phosphatase SixA  25.14 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.396252  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1035  hypothetical protein  34.97 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  28.32 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  25.86 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0091  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.88 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1688  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.06 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2177  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.93 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210616  hitchhiker  0.00370879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1965  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.52 
 
 
164 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590219  normal  0.236004 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0088  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.26 
 
 
209 aa  74.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.54 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.13 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  23.49 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4536  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.03 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.81 
 
 
445 aa  71.6  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  38.37 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2254  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1088  phosphoglycerate mutase family protein  24.26 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15890  phosphohistidine phosphatase SixA  31.98 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0507958  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1528  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.49 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0224  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.36 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.07 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2469  hypothetical protein  29.86 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.7 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  20.24 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.12 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>