162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1965 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1965  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
164 aa  333  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590219  normal  0.236004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2177  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  87.2 
 
 
164 aa  298  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210616  hitchhiker  0.00370879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2469  hypothetical protein  52.44 
 
 
166 aa  184  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1528  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  47.1 
 
 
179 aa  154  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_004310  BR1035  hypothetical protein  34.01 
 
 
166 aa  97.8  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0881  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.81 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00451478  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2121  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.89 
 
 
180 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88488  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.97 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  32.87 
 
 
175 aa  84.3  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  28.97 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17830  phosphoglycerate mutase family protein  33.11 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.99 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.37 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4984  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277019  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1070  hypothetical protein  31.68 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2731  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.68 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542354  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2863  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.3 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2363  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.72 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1113  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.2 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3058  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.52 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0426  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.56 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.407898  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0915  phosphohistidine phosphatase SixA  30.07 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.16 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  34.03 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.37 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3559  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.51 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.53 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1094  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.65 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.175026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4627  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.026372 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  29.58 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.17 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.29 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2573  phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370577  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.77 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1088  phosphoglycerate mutase family protein  27.4 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  35.26 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.14 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.34 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.33 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0656  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.78 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.93 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.52 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0420661  normal  0.240897 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1480  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.8 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.474903  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1082  phosphohistidine phosphatase SixA  30.56 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.396252  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.08 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4461  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.93 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1478  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.36 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.924383  normal  0.612523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1328  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.29 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1896  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.21 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0299  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.19 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4118  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.93 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0361837  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2579  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.49 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5540  hypothetical protein  32.69 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.48 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.74 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.53 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2408  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.55 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.773586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2309  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.26 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0733  phosphohistidine phosphatase SixA, putative  26.95 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00220786  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2814  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.5 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0501  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.12 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21760  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
174 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0322  putative phosphatase  29.63 
 
 
166 aa  61.6  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.629623  normal  0.448063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.17 
 
 
168 aa  61.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.41 
 
 
155 aa  61.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  29.66 
 
 
170 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  29.66 
 
 
170 aa  60.8  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0780  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.14 
 
 
143 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0386  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.43 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398558  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0659  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.41 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
439 aa  59.7  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1730  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.65 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.91 
 
 
170 aa  58.9  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  24.49 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1688  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
173 aa  57.4  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3078  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800804 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.35 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.6 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3906  Phosphoglycerate mutase  29.37 
 
 
170 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.08 
 
 
170 aa  54.3  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0498  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.08 
 
 
161 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0497  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.88 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.316739  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.88 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11918  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.56 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298677  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0631  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.28 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.73 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4970  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.83 
 
 
183 aa  52  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14439  predicted protein  27.7 
 
 
193 aa  52  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4536  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.06 
 
 
161 aa  52  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  42 
 
 
224 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.58 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.88 
 
 
153 aa  51.2  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
462 aa  51.2  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.08 
 
 
183 aa  51.2  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2377  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.58 
 
 
154 aa  51.2  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.67 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0806  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.15 
 
 
175 aa  50.8  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>