114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0733 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0733  phosphohistidine phosphatase SixA, putative  100 
 
 
163 aa  331  2e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00220786  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  44.24 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1088  phosphoglycerate mutase family protein  44.58 
 
 
164 aa  136  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1082  phosphohistidine phosphatase SixA  42.5 
 
 
170 aa  130  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.396252  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  42.5 
 
 
170 aa  130  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  42.5 
 
 
170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  45 
 
 
159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0915  phosphohistidine phosphatase SixA  41.25 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3078  Phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
167 aa  92  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800804 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2814  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.95 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2579  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.48 
 
 
167 aa  87.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.33 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  31.06 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  27.5 
 
 
175 aa  84.3  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.49 
 
 
164 aa  84.3  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.78 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17830  phosphoglycerate mutase family protein  31.68 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0656  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.27 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.86 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.61 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.84 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.38 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.22 
 
 
445 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4627  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.026372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.79 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1730  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.5 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1965  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.95 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590219  normal  0.236004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  23.08 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2177  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.66 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210616  hitchhiker  0.00370879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0299  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  23.27 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3559  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.71 
 
 
188 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  22.78 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.88 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.08 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0426  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  23.67 
 
 
185 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.407898  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  23.12 
 
 
174 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2469  hypothetical protein  27.35 
 
 
166 aa  57.4  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.51 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  23.75 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.71 
 
 
176 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  28.21 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.31 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  25.31 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0498  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.82 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0935  phosphoglycerate mutase family protein  25 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0059  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.8 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0689048  hitchhiker  0.00895006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  23.93 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0371  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  22.73 
 
 
446 aa  52.4  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.12 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0539  phosphohistidine phosphatase  28.75 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  25.64 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11918  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  25.64 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  24.79 
 
 
154 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0718  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.87 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  26.43 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  25 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.83 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3058  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  21.89 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.42 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1113  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  22.49 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  28.45 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  30.23 
 
 
462 aa  48.5  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  22.41 
 
 
171 aa  48.5  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.773586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.42 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4536  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.28 
 
 
161 aa  48.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0303  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  23.23 
 
 
146 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1094  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  22.67 
 
 
183 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.175026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.64 
 
 
150 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5540  hypothetical protein  22.49 
 
 
175 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21760  phosphohistidine phosphatase SixA  19.63 
 
 
174 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  25.53 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.69 
 
 
161 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  24.17 
 
 
218 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1581  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.89 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1528  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.52 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0314  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.23 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  26.05 
 
 
216 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  23.17 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2211  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.69 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.32 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.45 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  23.93 
 
 
152 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.87 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.41 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2307  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.13 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  26.21 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  26.02 
 
 
152 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  26.02 
 
 
152 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  24.79 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  22.63 
 
 
315 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2377  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.05 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3237  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.879445  normal  0.545559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.05 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.05 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  24.39 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>