51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3237 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3237  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.879445  normal  0.545559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2851  phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 		 189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.796237  normal  0.0465369 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  27.8 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 401 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  34.82 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  26.57 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57574  putative transcription initiation factor  26.99 
 
 		 439 aa  47.8  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.625866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  43.75 
 
 		 438 aa  46.6  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  23.53 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  28.27 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.8 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 		 238 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 		 238 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 		 238 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.3 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  38.96 
 
 		 245 aa  45.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 247 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 402 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  36.05 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  33.8 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  36.49 
 
 		 412 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  33.85 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.21 
 
 		 166 aa  43.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0733  phosphohistidine phosphatase SixA, putative  35.38 
 
 		 163 aa  42.7  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00220786  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.6 
 
 		 157 aa  42  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 226 aa  42  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 201 aa  42  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  35.24 
 
 		 261 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  40.68 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  39.34 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  36.36 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 		 440 aa  41.2  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  38.57 
 
 		 197 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 223 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>