More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0773 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 205 aa  413  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  58.17 
 
 		 216 aa  256  1e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  26.94 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  26.94 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  26.94 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  27.8 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  27.8 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 		 412 aa  67.8  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  34 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  26.5 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.44 
 
 		 449 aa  65.1  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  42.55 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.18 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  26.77 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  27.55 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  25.91 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  26.04 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  39.58 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  39.58 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  39.58 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  27.64 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  25.48 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  28.43 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  42.39 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  42.39 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.63 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  31.97 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  25.51 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.64 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  25.26 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  42.39 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  42.39 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.84 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  27.49 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  42.39 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  42.39 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  42.39 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  42.39 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  25.48 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.42 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  30.71 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  26.56 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  26.13 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  23.59 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  25.13 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  27.18 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>