135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3739 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  92.72 
 
 		 152 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  92.05 
 
 		 152 aa  278  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  89.26 
 
 		 152 aa  265  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  65.54 
 
 		 151 aa  190  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  64.24 
 
 		 154 aa  190  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  63.58 
 
 		 152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  62.25 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  61.74 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  58.55 
 
 		 156 aa  169  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  59.21 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.86 
 
 		 161 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.59 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.06 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  38.1 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  39.17 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.46 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.18 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  35.46 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.88 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  35.97 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  36.49 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  36.17 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  36.17 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  34.48 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  31.58 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.09 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  33.11 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  31.25 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.29 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.56 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.97 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.79 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  34.53 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.17 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  34.53 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.94 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  29.41 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.39 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  35.07 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.86 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0303  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.85 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0314  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.85 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.39 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.39 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.72 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  35.38 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.1 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.72 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  26.23 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  32.89 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.51 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.51 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.51 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.77 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  33.33 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.17 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.5 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.26 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.54 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.45 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0613  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.1 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.639252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.06 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2562  phosphohistidine phosphatase SixA  34.87 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  33.07 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4928  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.77 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.36 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.02 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.61 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.15 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.15 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1968  hypothetical protein  29.31 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.07 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.45 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.6 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.46 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.81 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.43 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  34.15 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.66 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.691963 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>