186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2845 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
315 aa  628  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  52.43 
 
 
310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  52.79 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  53.95 
 
 
302 aa  300  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
311 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
311 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
311 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  49.84 
 
 
317 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  46.65 
 
 
305 aa  242  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  42.9 
 
 
301 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  44.41 
 
 
315 aa  202  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  42.8 
 
 
292 aa  198  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  43.39 
 
 
314 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  38.75 
 
 
325 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
303 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  40.07 
 
 
301 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
322 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  43.45 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 
289 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  36.01 
 
 
333 aa  159  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  35.44 
 
 
314 aa  139  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  35.56 
 
 
336 aa  135  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
333 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  33.21 
 
 
308 aa  122  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  32.49 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  33.19 
 
 
322 aa  116  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  31 
 
 
356 aa  115  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  39.27 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  33.76 
 
 
395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  30.5 
 
 
343 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  29.58 
 
 
398 aa  109  6e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
326 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
153 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
139 aa  64.3  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
146 aa  62.4  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
182 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 
147 aa  60.8  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
164 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  32.35 
 
 
160 aa  60.1  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
138 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
147 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  30 
 
 
142 aa  58.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
166 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
536 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
219 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  41 
 
 
424 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
149 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  32.41 
 
 
203 aa  57  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.82 
 
 
577 aa  56.6  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
140 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
139 aa  56.6  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
166 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
140 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
161 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
151 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
174 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  26.39 
 
 
258 aa  54.3  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
157 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 
583 aa  53.1  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
180 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  27.08 
 
 
430 aa  52.4  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  26.5 
 
 
181 aa  51.2  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
272 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  26.87 
 
 
137 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
216 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 
139 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  34.91 
 
 
169 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  31.97 
 
 
203 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  31.97 
 
 
203 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  31.97 
 
 
203 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
143 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  29.52 
 
 
150 aa  50.1  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
143 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
182 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
302 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 
228 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
145 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 
211 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
148 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  31.53 
 
 
170 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
143 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1761  phosphoglycerate mutase family protein  28 
 
 
191 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3581  phosphoglycerate mutase family protein  31.46 
 
 
191 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  25.58 
 
 
150 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 
174 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
161 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
172 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
161 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.29 
 
 
134 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
153 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1580  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  28.8 
 
 
191 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000315491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1876  phosphoglycerate mutase family protein  28.8 
 
 
189 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>