146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3491 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
152 aa  298  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  89.26 
 
 
152 aa  265  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  86.84 
 
 
152 aa  263  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  86.18 
 
 
152 aa  260  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  65.33 
 
 
151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  62.67 
 
 
151 aa  191  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  64.67 
 
 
154 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  65.33 
 
 
152 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  62.67 
 
 
154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  58 
 
 
156 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  57.62 
 
 
150 aa  157  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.16 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.86 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.84 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  33.11 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  34.42 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.46 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  35.46 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  35.46 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  35.97 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.16 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  37.06 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  32.24 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.62 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.92 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.2 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  31.25 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  34.75 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  34.75 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  40 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  34.97 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.64 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.48 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  31.79 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.94 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  33.81 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.17 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  33.81 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.1 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.1 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  30.52 
 
 
166 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  33.13 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  34.33 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.79 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.37 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  36 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.69 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.43 
 
 
165 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.43 
 
 
165 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  35.71 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.09 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0303  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.91 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.59 
 
 
169 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0314  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.91 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.81 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.81 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.81 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.82 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.06 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.81 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.06 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.06 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.54 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.06 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.44 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.92 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.13 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  32.19 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.07 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  23.45 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.4 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.4 
 
 
153 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.6 
 
 
159 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.61 
 
 
182 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.8 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.43 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0188  phosphohistidine phosphatase SixA  31.29 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.07 
 
 
158 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.71 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.71 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.71 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.37 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2007  phosphohistidine phosphatase SixA homolog  31.29 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.76 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4928  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.96 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0733  phosphohistidine phosphatase SixA, putative  25.42 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00220786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.54 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  34.71 
 
 
216 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>