153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2215 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  100 
 
 
151 aa  300  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  87.42 
 
 
151 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  65.33 
 
 
152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  64.19 
 
 
152 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  64.19 
 
 
152 aa  190  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  65.54 
 
 
152 aa  190  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  64.67 
 
 
154 aa  187  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  63.33 
 
 
152 aa  183  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  62.67 
 
 
154 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  56 
 
 
156 aa  164  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  57.62 
 
 
150 aa  164  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.71 
 
 
161 aa  96.7  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.05 
 
 
159 aa  87  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  40 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  40.71 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.86 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  38.3 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.13 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  39.55 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.55 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  39.55 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  39.55 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  39.55 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  39.55 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  39.55 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  39.55 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  39.55 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  35.33 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  37.59 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.91 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  37.59 
 
 
160 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  40.58 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  35.77 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  35.21 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.69 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  35.34 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.21 
 
 
156 aa  72  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  37.14 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  37.14 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.77 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  38.52 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.29 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.11 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.29 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  32.03 
 
 
166 aa  67  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  32.65 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.69 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  37.04 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.97 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.9 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  34.96 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.21 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.15 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.15 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.39 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.15 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.15 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.06 
 
 
162 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0314  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.91 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0303  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.91 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  34.92 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.22 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.43 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  25.52 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  30.41 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.29 
 
 
182 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.87 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.34 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.99 
 
 
164 aa  57  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  35 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.59 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.59 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.06 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.15 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.37 
 
 
168 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  26.57 
 
 
165 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.1 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1082  phosphohistidine phosphatase SixA  27.34 
 
 
170 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.396252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.96 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.73 
 
 
170 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.92 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.92 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2564  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.77 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.83 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  27.34 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  29.08 
 
 
170 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.4 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.4 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.4 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.89 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>