211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1195 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
152 aa  303  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  98.68 
 
 
153 aa  300  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  88.16 
 
 
153 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  87.5 
 
 
153 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  87.5 
 
 
153 aa  269  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  87.5 
 
 
153 aa  269  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  87.5 
 
 
153 aa  267  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  73.68 
 
 
152 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  73.68 
 
 
152 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  72.37 
 
 
152 aa  233  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  72.37 
 
 
152 aa  233  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  72.37 
 
 
153 aa  233  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  72.37 
 
 
152 aa  233  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  72.37 
 
 
216 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  72.08 
 
 
218 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  65.13 
 
 
152 aa  200  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  65.79 
 
 
152 aa  199  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0892  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  69.08 
 
 
152 aa  196  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  51.27 
 
 
157 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  51.27 
 
 
163 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  56 
 
 
150 aa  155  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  49.06 
 
 
157 aa  153  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2175  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  50.31 
 
 
158 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  51.32 
 
 
150 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1215  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  47.02 
 
 
150 aa  140  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  47.17 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0433  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.74 
 
 
160 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255278 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  50 
 
 
153 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  47.68 
 
 
155 aa  133  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.21 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2307  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.51 
 
 
153 aa  124  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2211  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.2 
 
 
157 aa  124  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  45.1 
 
 
154 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2377  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.44 
 
 
154 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.41 
 
 
157 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.21 
 
 
154 aa  117  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.56 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.36 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.62 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4970  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.51 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  31.45 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.17 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  40.17 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  38.4 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  32.52 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.43 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.13 
 
 
159 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.87 
 
 
158 aa  60.5  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  32.54 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.67 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  33.06 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  33.06 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  33.33 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  33.33 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  33.33 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  33.33 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  32 
 
 
166 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  33.33 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.87 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.45 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.71 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.63 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  28.1 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.89 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.23 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  27.27 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  35.94 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.89 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.97 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  30.33 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  30.4 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  30.33 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.37 
 
 
177 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  30.33 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  30.33 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.773586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.35 
 
 
182 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3936  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.36 
 
 
198 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  35.77 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4010  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.36 
 
 
198 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.461298  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  29.6 
 
 
181 aa  53.9  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  26.12 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3951  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.36 
 
 
198 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0128792 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.19 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.71 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  35.77 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>