183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2441 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
167 aa  341  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.32 
 
 
168 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  33.54 
 
 
175 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
164 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2579  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.5 
 
 
167 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.87 
 
 
164 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  33.96 
 
 
166 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 
166 aa  97.8  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.62 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.75 
 
 
163 aa  92  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  31.39 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2814  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.12 
 
 
164 aa  87.8  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17830  phosphoglycerate mutase family protein  34.03 
 
 
160 aa  85.5  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.73 
 
 
161 aa  84.7  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.72 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0915  phosphohistidine phosphatase SixA  28.86 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1082  phosphohistidine phosphatase SixA  27.61 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.396252  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  27.61 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.56 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  27.61 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0656  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.95 
 
 
166 aa  79  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.74 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0631  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.36 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3078  Phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1478  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.24 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.924383  normal  0.612523 
 
 
-
 
NC_004310  BR1035  hypothetical protein  34.78 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  26.25 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  31.41 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.71 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1088  phosphoglycerate mutase family protein  28.66 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4118  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.18 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0361837  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0806  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.71 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.86 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1113  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.07 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0935  phosphoglycerate mutase family protein  30.67 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.25 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0426  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.79 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.407898  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0659  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.11 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4461  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.78 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.5 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4970  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.13 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5540  hypothetical protein  29.07 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2309  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.34 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0322  putative phosphatase  26.51 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.629623  normal  0.448063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.07 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.73 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.56 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1094  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.68 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.175026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0299  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.89 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2863  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.09 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.65 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.17 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.3 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3058  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.7 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2121  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.04 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.67 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.36 
 
 
170 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1070  hypothetical protein  27.88 
 
 
168 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.67 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2469  hypothetical protein  28.15 
 
 
166 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2408  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.05 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.17 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1328  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.21 
 
 
179 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2731  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.92 
 
 
168 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542354  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3504  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 
165 aa  61.6  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2177  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.09 
 
 
164 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210616  hitchhiker  0.00370879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1730  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.59 
 
 
172 aa  61.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.92 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0733  phosphohistidine phosphatase SixA, putative  22.78 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00220786  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.33 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  30.71 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4627  phosphoglycerate mutase  25.15 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.026372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.15 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.26 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4536  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.31 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2564  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
167 aa  58.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0423  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.762465 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.64 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.22 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.51 
 
 
171 aa  58.2  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.41 
 
 
169 aa  58.2  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0539  phosphohistidine phosphatase  32.23 
 
 
185 aa  58.2  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3521  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.67 
 
 
175 aa  57.4  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000585332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.12 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26931  phosphohistidine phosphatase SixA  28.08 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1480  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.84 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.474903  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2320  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.71 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.825769  normal  0.76256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4278  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.89 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2562  phosphohistidine phosphatase SixA  30 
 
 
161 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03360  phosphohistidine phosphatase SixA  28.82 
 
 
174 aa  55.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0498  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.61 
 
 
161 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0881  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.28 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00451478  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15890  phosphohistidine phosphatase SixA  28.57 
 
 
175 aa  55.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0507958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0386  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.91 
 
 
170 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398558  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.51 
 
 
166 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4984  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.45 
 
 
183 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277019  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  27.63 
 
 
169 aa  54.3  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.77 
 
 
445 aa  54.3  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>