175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0878 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
182 aa  353  6.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2562  phosphohistidine phosphatase SixA  53.99 
 
 
161 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  48.34 
 
 
167 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2564  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.03 
 
 
167 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.62 
 
 
170 aa  98.2  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2231  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.05 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.571995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1996  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.79 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03624e-17 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.49 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.18 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.49 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.67 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0613  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.72 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.639252  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.58 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.64 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.29 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17830  phosphoglycerate mutase family protein  33.57 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  32.03 
 
 
159 aa  72  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.58 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.74 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.04 
 
 
152 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.81 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.76 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.57 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.07 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26931  phosphohistidine phosphatase SixA  40.27 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  35.25 
 
 
160 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.25 
 
 
160 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.34 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.57 
 
 
162 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.33 
 
 
156 aa  61.6  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  38.03 
 
 
157 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0892  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.78 
 
 
152 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.85 
 
 
170 aa  61.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.16 
 
 
161 aa  61.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.36 
 
 
169 aa  60.8  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.68 
 
 
164 aa  60.8  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1581  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.54 
 
 
166 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  35.62 
 
 
154 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  27.46 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  34.93 
 
 
154 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.18 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  27.46 
 
 
170 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  29.71 
 
 
157 aa  58.2  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  33.57 
 
 
216 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.51 
 
 
152 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21760  phosphohistidine phosphatase SixA  38.71 
 
 
174 aa  58.2  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1088  phosphoglycerate mutase family protein  30.91 
 
 
164 aa  57.8  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  31.29 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  34.45 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  33.8 
 
 
218 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.06 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.82 
 
 
153 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.06 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.06 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.27 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.09 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.73 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2307  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.71 
 
 
153 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0316  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.79 
 
 
149 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.778413  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4928  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.56 
 
 
146 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  34.06 
 
 
153 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  34.06 
 
 
152 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.35 
 
 
152 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2211  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.8 
 
 
157 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  34.06 
 
 
152 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  34.06 
 
 
152 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.97 
 
 
162 aa  54.7  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
150 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.97 
 
 
164 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.33 
 
 
155 aa  53.9  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.13 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  27.98 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2579  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.46 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
152 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
152 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  29.25 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.61 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  28.66 
 
 
161 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  28.66 
 
 
161 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  28.66 
 
 
161 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0423  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.54 
 
 
168 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.762465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  28.66 
 
 
161 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2377  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.06 
 
 
154 aa  52  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  28.66 
 
 
161 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4278  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.4 
 
 
175 aa  51.6  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
154 aa  51.6  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.61 
 
 
152 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.58 
 
 
161 aa  51.2  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.45 
 
 
152 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.88 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.14 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.45 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.84 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.51 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.26 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2814  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.84 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.45 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.69 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>