257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1207 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
162 aa  315  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.19 
 
 
161 aa  85.5  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.94 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.31 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.55 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  44.2 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.5 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.41 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.15 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  39.86 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.9 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.8 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  24.16 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4928  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.96 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2564  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.54 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228315  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2231  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.64 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.571995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.89 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  37.82 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.67 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.37 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.18 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17830  phosphoglycerate mutase family protein  33.58 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  28.15 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1996  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.12 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03624e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.57 
 
 
182 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.34 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0059  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.17 
 
 
185 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0689048  hitchhiker  0.00895006 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.09 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.72 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3504  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107092  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.67 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0582  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.02 
 
 
146 aa  61.6  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.016347  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2211  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.24 
 
 
157 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
439 aa  60.8  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.03 
 
 
163 aa  60.5  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  27.82 
 
 
175 aa  60.5  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  37.19 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  23.87 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.58 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.36 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  28.75 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.36 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.36 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.09 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.94 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.75 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.19 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  33.81 
 
 
158 aa  58.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0539  phosphohistidine phosphatase  30.83 
 
 
185 aa  58.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.54 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2121  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.82 
 
 
180 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.54 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.54 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.35 
 
 
154 aa  58.2  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1288  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.82 
 
 
165 aa  58.2  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.54 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2562  phosphohistidine phosphatase SixA  35.54 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4278  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.02 
 
 
175 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.43 
 
 
170 aa  57.8  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.48 
 
 
164 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.37 
 
 
158 aa  57.4  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.8 
 
 
165 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  30 
 
 
166 aa  57.4  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  39.34 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.54 
 
 
156 aa  57.4  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.97 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.12 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0498  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.13 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  40.91 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0433  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.17 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.4 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.27 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.54 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  35.51 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.5 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.47 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0497  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.11 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.316739  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.13 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2377  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.68 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.83 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.88 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  38.28 
 
 
203 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  38.28 
 
 
203 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  38.28 
 
 
203 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.59 
 
 
159 aa  54.7  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.65 
 
 
158 aa  54.7  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2814  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.75 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.67 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.2 
 
 
161 aa  53.9  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.84 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1730  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.86 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.57 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0935  phosphoglycerate mutase family protein  31.93 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1896  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.2 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  36.44 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  38.58 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2579  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.77 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.32 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.2 
 
 
169 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>