186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1534 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  100 
 
 		 166 aa  344  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  70.32 
 
 		 157 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  66.06 
 
 		 170 aa  229  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  65.82 
 
 		 162 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  64.47 
 
 		 156 aa  210  9e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  63.82 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  59.62 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  58.97 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  58.97 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  58.97 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  58.97 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  58.33 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  58.97 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  57.69 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  57.69 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  57.05 
 
 		 156 aa  190  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  43.36 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  43.48 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  42.86 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  42.45 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  43.07 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.07 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  43.07 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  43.07 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  43.07 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  43.07 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  43.07 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  43.07 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  43.07 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  41.55 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  42.34 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  42.34 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  42.34 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  42.34 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  42.34 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  42.86 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  40.88 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  45.26 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.43 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  42.04 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  42.04 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  40.88 
 
 		 160 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  42.76 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.3 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  41.45 
 
 		 158 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  38.67 
 
 		 175 aa  91.3  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  29.38 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  38.21 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  35.77 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.79 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  31.85 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.94 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  31.13 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.24 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.92 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.92 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  32.08 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.4 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.45 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.58 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.58 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.08 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.72 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  33.33 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.82 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.45 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.29 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.15 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.61 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.8 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.03 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  35.2 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.03 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  30.26 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  35.2 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  35.2 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.61 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  33.6 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  33.6 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  35.2 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0393  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.58 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0246884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.28 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.88 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.6 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.6 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.6 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.8 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.28 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.09 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.6 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  33.33 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  33.6 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.52 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  33.07 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1478  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.65 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.924383  normal  0.612523 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.16 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>