More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1002 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
164 aa  327  6e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  45.51 
 
 
164 aa  137  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.04 
 
 
159 aa  92  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.41 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.55 
 
 
164 aa  91.3  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.58 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
161 aa  84.3  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.94 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  33.54 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  33.54 
 
 
163 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0423  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.75 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.762465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.13 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.53 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.42 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0613  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.13 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.639252  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.33 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.25 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.06 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.74 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.81 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  32.7 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1581  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.83 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  27.61 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  27.61 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  27.61 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  27.61 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  35 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.09 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.49 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  35.71 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  35 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  29.59 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26931  phosphohistidine phosphatase SixA  35.97 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  26.38 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.51 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.99 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.88 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  26.99 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  33.73 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.85 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.13 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.19 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.85 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  27.16 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.88 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  29.01 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.86 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.27 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  28.22 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.22 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  28.22 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  28.22 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  28.22 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  28.22 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  28.22 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  27.16 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.94 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.59 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  28.66 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2564  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.19 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  35.48 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.63 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2562  phosphohistidine phosphatase SixA  33.55 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  34.13 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.01 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.72 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.06 
 
 
158 aa  62  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  28 
 
 
181 aa  61.6  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.93 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.19 
 
 
168 aa  60.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.68 
 
 
182 aa  60.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  30.77 
 
 
154 aa  60.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  28.05 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  28.28 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.87 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.87 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0188  phosphohistidine phosphatase SixA  32.26 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  31.21 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  28.49 
 
 
166 aa  58.2  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2007  phosphohistidine phosphatase SixA homolog  32.26 
 
 
159 aa  57.8  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.23 
 
 
157 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  25 
 
 
157 aa  57.8  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0940  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.92 
 
 
153 aa  57.8  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.29 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.29 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2363  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.68 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.29 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.23 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.29 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  30.61 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  28.06 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.4 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2175  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.61 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.61 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.61 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.53 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.66 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.25 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>