188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3007 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
153 aa  300  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  57.52 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2211  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  58.6 
 
 
157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.29 
 
 
153 aa  158  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  56.21 
 
 
150 aa  158  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  51.59 
 
 
157 aa  157  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2377  phosphohistidine phosphatase, SixA  54.61 
 
 
154 aa  157  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  54.9 
 
 
153 aa  156  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  53.95 
 
 
154 aa  156  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.94 
 
 
150 aa  154  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  51.95 
 
 
153 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.6 
 
 
153 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.6 
 
 
153 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.6 
 
 
153 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  51.3 
 
 
153 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  50 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2307  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  50.33 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  50.65 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1215  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  50.34 
 
 
150 aa  144  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  50.65 
 
 
153 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  50 
 
 
152 aa  143  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  49.35 
 
 
152 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  51.27 
 
 
157 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  51.59 
 
 
163 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  51.3 
 
 
218 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  51.3 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  51.95 
 
 
216 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  51.3 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  51.3 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  51.3 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  50.96 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0433  phosphohistidine phosphatase, SixA  47.06 
 
 
160 aa  138  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255278 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  51.3 
 
 
152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  51.3 
 
 
152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  46.2 
 
 
158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2175  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  47.47 
 
 
158 aa  127  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0892  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  48.7 
 
 
152 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.19 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.56 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.56 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.56 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.56 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.89 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.89 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.89 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.48 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.89 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.89 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.56 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.54 
 
 
170 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.16 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.56 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  31.25 
 
 
166 aa  61.6  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.65 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  36.07 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.07 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.92 
 
 
162 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  36.07 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  36.07 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  36.07 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  36.07 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  36.07 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  36.07 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  36.07 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.33 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.35 
 
 
161 aa  60.5  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.07 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.06 
 
 
174 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  33.61 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.29 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  34.43 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  34.43 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  34.43 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4278  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.5 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  34.43 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  34.43 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.17 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.48 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.67 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  33.33 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  30.47 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  33.87 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.27 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  35.25 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  33.08 
 
 
169 aa  53.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  32.26 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  30.4 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0498  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.46 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.04 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.86 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  28.8 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.84 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1581  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.63 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  35 
 
 
169 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0216  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.54 
 
 
170 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15890  phosphohistidine phosphatase SixA  33.9 
 
 
175 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0507958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.32 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>