171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2810 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
158 aa  322  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  46.15 
 
 
160 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  45.83 
 
 
161 aa  127  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  44.9 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.9 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  44.9 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  44.9 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  44.9 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  44.9 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  44.9 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  44.9 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  44.9 
 
 
161 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  46.95 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  47.13 
 
 
160 aa  124  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  43.59 
 
 
161 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  43.59 
 
 
161 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.65 
 
 
161 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  43.59 
 
 
161 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  43.59 
 
 
161 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  45.39 
 
 
154 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  46.1 
 
 
154 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.2 
 
 
156 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  47.89 
 
 
157 aa  120  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  42.95 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.75 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  46.43 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.25 
 
 
156 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.03 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  45.39 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  42.31 
 
 
163 aa  114  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  42.31 
 
 
163 aa  114  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  41.76 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.3 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  42.03 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  40.43 
 
 
166 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.55 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  42.38 
 
 
158 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.86 
 
 
156 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.86 
 
 
156 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.86 
 
 
156 aa  107  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.86 
 
 
156 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.68 
 
 
156 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.68 
 
 
156 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.68 
 
 
156 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.68 
 
 
156 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  39.72 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.7 
 
 
152 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.7 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.86 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  40 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  40 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  36.99 
 
 
175 aa  85.5  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.59 
 
 
152 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  40.14 
 
 
154 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  40.85 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.29 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.34 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.37 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  35.9 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.85 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  34.27 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.51 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  34.19 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.62 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.7 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.17 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.63 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.87 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.87 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.87 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.87 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.87 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.07 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.96 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.77 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.34 
 
 
174 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.26 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.66 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  34.15 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.33 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.5 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.34 
 
 
174 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  27.66 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.55 
 
 
175 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.57 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.58 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1968  hypothetical protein  28.69 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1962  hypothetical protein  28.69 
 
 
155 aa  51.6  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0386  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.71 
 
 
170 aa  51.2  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398558  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.58 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.18 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.06 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  30.56 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  30.56 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  30.65 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  30.65 
 
 
216 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  30.65 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  30.65 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>