108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1962 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1962  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  318  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1968  hypothetical protein  98.06 
 
 
155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0940  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.83 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0393  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.82 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0246884  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1257  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.95 
 
 
153 aa  110  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.204304  normal  0.125105 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0582  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.14 
 
 
146 aa  102  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.016347  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2007  phosphohistidine phosphatase SixA homolog  33.99 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0188  phosphohistidine phosphatase SixA  33.99 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0156  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.76 
 
 
148 aa  95.5  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1554  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.14 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0142  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.97 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.86 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  27.7 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.7 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  27.7 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  27.7 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  27.7 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  27.7 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  27.7 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  27.7 
 
 
161 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  27.7 
 
 
161 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  31.16 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.75 
 
 
176 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.99 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.39 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.45 
 
 
156 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.45 
 
 
156 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  30.07 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4984  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.67 
 
 
183 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277019  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  26.42 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.73 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.73 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.73 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0423  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.4 
 
 
168 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.762465 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.73 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.73 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  26.77 
 
 
166 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.93 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.73 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  26.35 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  26.35 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  26.35 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  26.35 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.27 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.73 
 
 
162 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  28.12 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  24.32 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.34 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  27.69 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.34 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.08 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.25 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  30.41 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1480  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 
185 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.474903  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.69 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.08 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.4 
 
 
161 aa  51.2  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  26.76 
 
 
154 aa  51.2  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.41 
 
 
170 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.92 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.67 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1581  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.87 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  27.5 
 
 
216 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  21.66 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.41 
 
 
153 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.41 
 
 
153 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  28.15 
 
 
152 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  28.15 
 
 
152 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.41 
 
 
153 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.8 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  25.16 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  27.41 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  27.54 
 
 
218 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.41 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.67 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  27.41 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  27.41 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  27.41 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  25 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.67 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.6 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.39 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.44 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.71 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.47 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  22.46 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.81 
 
 
152 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.5 
 
 
152 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.68 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.15 
 
 
161 aa  43.9  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.97 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.27 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.66 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  23.53 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  22.98 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15890  phosphohistidine phosphatase SixA  28.57 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0507958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.62 
 
 
167 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.72 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2175  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.03 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.74 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>