48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0940 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0940  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
153 aa  315  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1257  phosphohistidine phosphatase, SixA  48.68 
 
 
153 aa  154  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.204304  normal  0.125105 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1968  hypothetical protein  41.83 
 
 
155 aa  127  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1962  hypothetical protein  41.83 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0156  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.67 
 
 
148 aa  114  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0582  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.13 
 
 
146 aa  114  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.016347  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0393  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.13 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0246884  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1554  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.47 
 
 
146 aa  94  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0188  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2007  phosphohistidine phosphatase SixA homolog  33.99 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0142  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.97 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
157 aa  67  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.92 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.87 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  21.74 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  28.75 
 
 
154 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.88 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  35.43 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.68 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.9 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.77 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  24.59 
 
 
161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  24.59 
 
 
161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  24.59 
 
 
161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  24.59 
 
 
161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  24.59 
 
 
161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  27.97 
 
 
156 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.91 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.95 
 
 
159 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  26.42 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.86 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  24.68 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1528  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.29 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1215  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.35 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.25 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.25 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  27.59 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0423  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.54 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.762465 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.32 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.15 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  30.16 
 
 
158 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.06 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.06 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  20.75 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  26.89 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.38 
 
 
169 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>