188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2016 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 157 aa  313  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  98.09 
 
 		 163 aa  308  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  89.1 
 
 		 157 aa  284  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  63.06 
 
 		 158 aa  204  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2175  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  63.69 
 
 		 158 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  53.16 
 
 		 216 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  54.43 
 
 		 152 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  54.43 
 
 		 152 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  54.43 
 
 		 153 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  54.43 
 
 		 152 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  53.8 
 
 		 153 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  54.43 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  54.43 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.53 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.53 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.53 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  51.9 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  53.75 
 
 		 218 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  51.9 
 
 		 152 aa  157  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  51.27 
 
 		 152 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  50.63 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.56 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  49.37 
 
 		 152 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0433  phosphohistidine phosphatase, SixA  50.96 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1215  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  50 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  49.68 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0892  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  48.1 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.95 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  50.96 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  46.5 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2211  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  45.22 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.23 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2377  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.23 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.95 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.31 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.31 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2307  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.31 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.8 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  42.31 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.46 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.51 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  40.91 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  40.77 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.37 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.08 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.82 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.08 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.85 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.1 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.46 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  35.61 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  35 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  38.46 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  32.58 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  36.22 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.97 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.97 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.96 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.2 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.23 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.06 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.99 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.08 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.86 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1581  phosphohistidine phosphatase, SixA  35 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.08 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.72 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.08 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  30.47 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.08 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  33.08 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.88 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.47 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  32.56 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.56 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  32.56 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  32.56 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  32.56 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  32.56 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  32.56 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.5 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  32.56 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  32.56 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.92 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  32.56 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.04 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  29.77 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1962  hypothetical protein  27.34 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  34.11 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11302  hypothetical protein  36.72 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  34.11 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>