170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2175 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2175  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  78.48 
 
 		 158 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  63.92 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  63.69 
 
 		 157 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  63.69 
 
 		 163 aa  197  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  56.6 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  56.6 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  56.6 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  56.6 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  56.6 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  56.6 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  54.72 
 
 		 216 aa  157  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  54.72 
 
 		 153 aa  155  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  55.97 
 
 		 218 aa  153  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.83 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.83 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  50.94 
 
 		 153 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0433  phosphohistidine phosphatase, SixA  49.37 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  50.31 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1215  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  49.68 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  55.06 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.2 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  50.31 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0892  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  54.09 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  49.06 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  49.06 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  46.2 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.12 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  46.2 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2307  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  45.57 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.94 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2211  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.94 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2377  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.68 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.04 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.41 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  47.47 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.04 
 
 		 154 aa  111  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  39.53 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.11 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  33.59 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.42 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.85 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0423  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.762465 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.2 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03360  phosphohistidine phosphatase SixA  38.17 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  30.77 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  30.77 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.77 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  30.77 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  30.77 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  30.77 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11302  hypothetical protein  39.17 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  30.77 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  30.77 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  30.77 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  30.5 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.89 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4970  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.82 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  36.43 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.14 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  30 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  30 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  30 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  30 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  30 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.48 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.03 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.92 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.83 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.14 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3936  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.86 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4010  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.86 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.461298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3951  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.86 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0128792 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  27.69 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.6 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.9 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.87 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.37 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  30.71 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.22 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  37.19 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  29.81 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  29.81 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4437  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.06 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0979353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4984  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.98 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.06 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.78 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.94 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.08 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.23 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  29.81 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15890  phosphohistidine phosphatase SixA  33.06 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0507958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.83 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  29.37 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.73 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.83 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.83 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>