163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1313 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  100 
 
 
161 aa  330  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
161 aa  330  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  100 
 
 
161 aa  330  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  330  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  100 
 
 
161 aa  330  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  100 
 
 
161 aa  330  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  100 
 
 
161 aa  330  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  98.76 
 
 
161 aa  327  6e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  98.76 
 
 
161 aa  326  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  89.44 
 
 
161 aa  300  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  89.44 
 
 
161 aa  300  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  89.44 
 
 
161 aa  300  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  89.44 
 
 
161 aa  300  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  87.58 
 
 
161 aa  298  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  88.82 
 
 
161 aa  297  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  68.75 
 
 
160 aa  218  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  66.67 
 
 
160 aa  202  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  66.03 
 
 
160 aa  202  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  60.26 
 
 
162 aa  190  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  64.6 
 
 
163 aa  187  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  64.6 
 
 
163 aa  186  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  58.97 
 
 
161 aa  180  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  63.46 
 
 
158 aa  177  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  46.15 
 
 
156 aa  133  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.31 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.86 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.9 
 
 
158 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.95 
 
 
156 aa  121  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.31 
 
 
156 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.67 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.31 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.31 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.67 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.67 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.67 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.67 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  41.67 
 
 
156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  43.07 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.03 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.76 
 
 
170 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.78 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  40 
 
 
154 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  38.71 
 
 
154 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  39.72 
 
 
181 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  37.72 
 
 
166 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  41.03 
 
 
157 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.14 
 
 
157 aa  90.9  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  37.84 
 
 
175 aa  87.8  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  39.55 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.51 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.51 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.19 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.46 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  38.06 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.46 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.06 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.02 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  33.56 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.22 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  32.89 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1968  hypothetical protein  28.38 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.22 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.71 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.85 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.36 
 
 
153 aa  62  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1962  hypothetical protein  27.7 
 
 
155 aa  61.6  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1215  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.48 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.88 
 
 
153 aa  60.8  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.81 
 
 
164 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.89 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  34.78 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.36 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.04 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.15 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0142  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.13 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.3 
 
 
159 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 
159 aa  57.4  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.95 
 
 
174 aa  57.4  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  31.54 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.85 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2175  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.77 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.85 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1581  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.29 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.38 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.56 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0781  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.95 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.56 
 
 
157 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
152 aa  54.3  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  24.55 
 
 
176 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
216 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.07 
 
 
153 aa  53.9  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  32.52 
 
 
153 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>