125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1285 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  100 
 
 
152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  90.13 
 
 
152 aa  286  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  53.33 
 
 
151 aa  170  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  35.42 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  33.8 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  34.01 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  34.03 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.64 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.64 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.27 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.25 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  31.34 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  35.2 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.25 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  32.65 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.2 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  30.72 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.4 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.07 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  32.8 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.26 
 
 
161 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.83 
 
 
170 aa  60.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.9 
 
 
156 aa  60.5  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  31.54 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.67 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.06 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.77 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  33.06 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.17 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.33 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.03 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.03 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.03 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.03 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.03 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.03 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.03 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.72 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.23 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  31.29 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.58 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2175  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.5 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  31.03 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  30 
 
 
160 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  27.14 
 
 
169 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  30.71 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.89 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0892  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.78 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  26.43 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.43 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.07 
 
 
163 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  27.69 
 
 
161 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  28.89 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  28.89 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  26.43 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  26.43 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  26.43 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  30 
 
 
163 aa  51.6  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  26.43 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.15 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  26.43 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.07 
 
 
157 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 
153 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  27.69 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.37 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.07 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.07 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.41 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.41 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  30.07 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.84 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  29.77 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  29.23 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.3 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.66 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.89 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.52 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  31.11 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  27.69 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  27.69 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  27.69 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  26.21 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  27.69 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  28.15 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  28.15 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  28.15 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  28.15 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.9 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  29.92 
 
 
216 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.31 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  45 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.66 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.14 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  26.92 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.92 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.83 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.69 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0433  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.06 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255278 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>