133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1667 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 157 aa  327  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  41.25 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  33.97 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.55 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  36.43 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  36.43 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  36.43 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  36.43 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  36.43 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  36.36 
 
 		 166 aa  91.7  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  37.14 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.14 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  37.14 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  37.14 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  37.14 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  37.14 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  38.3 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  37.14 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  37.14 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  37.14 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  35.06 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  36.36 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  36.43 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.79 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  33.11 
 
 		 163 aa  87.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  33.11 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  31.13 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  32.88 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  31.13 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  31.87 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.59 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  32.08 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.66 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.51 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  29.08 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.08 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  31.2 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  29.08 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.65 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.37 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.09 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.66 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.37 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.37 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.76 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.24 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.24 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.95 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.24 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.24 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.24 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.24 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.37 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.5 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  34.45 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.29 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  30 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.95 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.62 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2377  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.62 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.35 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  29.17 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.43 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  31.4 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.9 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.27 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.15 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  30.25 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.99 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.4 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.37 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.6 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.86 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.86 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  35.96 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.47 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.69 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.97 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.2 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.47 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2320  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.48 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.825769  normal  0.76256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.4 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.35 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0539  phosphohistidine phosphatase  36.67 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.88 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  27.88 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0433  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.08 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255278 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  28.68 
 
 		 218 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  30.97 
 
 		 216 aa  47.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1215  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.05 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  27.56 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  24.62 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  27.56 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  27.56 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0892  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.94 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>