144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2024 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  100 
 
 
151 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  87.42 
 
 
151 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  62.67 
 
 
152 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  61.74 
 
 
152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  60.14 
 
 
152 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  60.14 
 
 
152 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  61.33 
 
 
152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  61.33 
 
 
154 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  60 
 
 
154 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  54.67 
 
 
156 aa  159  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  55.63 
 
 
150 aa  154  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.06 
 
 
161 aa  89.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  40 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.65 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  40 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.14 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.97 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  38.21 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.41 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.06 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  35.46 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  38.06 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  36.17 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  36.17 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  34.01 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  34.33 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  35.07 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  35.07 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  35.07 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  35.07 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.81 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  35.07 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  37.14 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  37.14 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  39.5 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.68 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  37.82 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  36.62 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  38.66 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.65 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.9 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.96 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  30 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  31.76 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  37.04 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  34.15 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.39 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.39 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
170 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.14 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.71 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.71 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.71 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.71 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.71 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.71 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.71 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  29.17 
 
 
165 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.45 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.93 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.61 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.45 
 
 
182 aa  57.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2562  phosphohistidine phosphatase SixA  37.14 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0393  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0246884  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.91 
 
 
168 aa  53.9  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0733  phosphohistidine phosphatase SixA, putative  28.21 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00220786  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.9 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.17 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1082  phosphohistidine phosphatase SixA  28.57 
 
 
170 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.396252  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  34.04 
 
 
157 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2564  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.62 
 
 
167 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228315  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0303  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.02 
 
 
146 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0314  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.02 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.66 
 
 
168 aa  51.2  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  33.33 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.25 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.25 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.65 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.15 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.24 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.86 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  25 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.93 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  28.57 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.21 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  28.57 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.63 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26931  phosphohistidine phosphatase SixA  33.06 
 
 
175 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1435  phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 
193 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.5 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.94 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>