175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2670 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 157 aa  323  6e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  71.61 
 
 		 170 aa  237  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  71.61 
 
 		 162 aa  234  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  70.32 
 
 		 166 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  68.39 
 
 		 156 aa  228  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  67.1 
 
 		 156 aa  224  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  67.1 
 
 		 156 aa  223  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  67.74 
 
 		 156 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  67.74 
 
 		 156 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  67.74 
 
 		 156 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  67.74 
 
 		 156 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  66.45 
 
 		 156 aa  221  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  66.45 
 
 		 156 aa  221  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  65.16 
 
 		 156 aa  220  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  62.58 
 
 		 156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  61.29 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  42.86 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.86 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  42.86 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  42.86 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  42.86 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  42.86 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  42.86 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  44.53 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  44.53 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  44.2 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  42.55 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  43.8 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  43.8 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  43.8 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  43.8 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  43.8 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.75 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  38.71 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  40.82 
 
 		 160 aa  117  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  38.06 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  42.14 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  42.14 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  43.36 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  43.36 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.47 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  38.85 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.3 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  42.75 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  32.67 
 
 		 181 aa  95.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  37.25 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  37.76 
 
 		 175 aa  87.8  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.25 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.5 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.5 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.66 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  32.3 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.03 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.38 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.48 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  32.3 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.96 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.8 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.79 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  32.39 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  31.4 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  32.39 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.09 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.84 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.4 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.16 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.58 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.51 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  31.82 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.15 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  28.85 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.87 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.33 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.56 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.8 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.6 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.6 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.6 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2211  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.83 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  25 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17830  phosphoglycerate mutase family protein  28.21 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.81 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.2 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2320  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.38 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.825769  normal  0.76256 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  32 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  32 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  32 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  32 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  32 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  32 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.82 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.46 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.4 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0433  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.2 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.22 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.06 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>