161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2307 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2307  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  69.43 
 
 		 157 aa  223  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  66.67 
 
 		 153 aa  218  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  59.87 
 
 		 154 aa  191  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2377  phosphohistidine phosphatase, SixA  59.87 
 
 		 154 aa  191  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  58.82 
 
 		 154 aa  186  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  58.82 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2211  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  64.97 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  51.63 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  49.02 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  50 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  50.33 
 
 		 153 aa  147  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  48.7 
 
 		 152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0433  phosphohistidine phosphatase, SixA  46.41 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  46.2 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.75 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1215  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.74 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.51 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2175  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  45.57 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.51 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  45.45 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  45.45 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.81 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.81 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  45.45 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  45.45 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  45.45 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  45.45 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  45.45 
 
 		 216 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.86 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  43.67 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0892  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.75 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  45.45 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  45.45 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  44.81 
 
 		 218 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.31 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.31 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.41 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.21 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.06 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.03 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.55 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.34 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.82 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.37 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.36 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2562  phosphohistidine phosphatase SixA  34.09 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.22 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.71 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.62 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.69 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0423  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.06 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.762465 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  32.8 
 
 		 462 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15890  phosphohistidine phosphatase SixA  30.51 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0507958  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.06 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  32.23 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.83 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.2 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4970  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.96 
 
 		 183 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  34.56 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.5 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  39.68 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.48 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1088  phosphoglycerate mutase family protein  29.46 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2309  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.23 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.39 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.4 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.62 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  30.23 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.23 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.21 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  34.21 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.21 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.03 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  31.36 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.36 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4627  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.026372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  33.09 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.26 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1187  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.13 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.130785  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3936  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.97 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03360  phosphohistidine phosphatase SixA  32.28 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4010  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.97 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.461298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4118  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0361837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.85 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.75 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.22 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.85 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3951  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.83 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0128792 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.65 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  29.6 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11302  hypothetical protein  30.25 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.22 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0935  phosphoglycerate mutase family protein  34.19 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  31.11 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.34 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>