45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4015 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 134 aa  262  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  38.52 
 
 		 308 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 322 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  45.35 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  41.67 
 
 		 336 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  34.55 
 
 		 314 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  33.33 
 
 		 325 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 311 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 311 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  33.04 
 
 		 292 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 351 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  41.11 
 
 		 305 aa  50.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 333 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 311 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 315 aa  48.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.29 
 
 		 315 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  30.89 
 
 		 317 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.74 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 333 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  35.96 
 
 		 301 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2307  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.22 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  29.81 
 
 		 398 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.38 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 		 301 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 326 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 289 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  40.62 
 
 		 395 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 299 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.86 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  41 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  39 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.96 
 
 		 153 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 303 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  29.87 
 
 		 165 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.83 
 
 		 153 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  41.67 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  33.61 
 
 		 343 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.87 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 324 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.34 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 274 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 310 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 303 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>