110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0876 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 333 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  37.54 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  41.54 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  36.45 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  40.41 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  39.44 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  37.77 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  36.23 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  40.36 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  43.43 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  37.83 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  34.98 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  38.11 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  31.48 
 
 		 398 aa  133  5e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.46 
 
 		 315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  37.46 
 
 		 311 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  37.46 
 
 		 311 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  38.43 
 
 		 311 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  38.43 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  37.22 
 
 		 303 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  34.63 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  35.91 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  33.2 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.81 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 		 153 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 129 aa  57  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 144 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.29 
 
 		 577 aa  53.5  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 143 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 137 aa  53.1  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 147 aa  52.8  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 140 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 166 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 		 136 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 140 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 139 aa  50.8  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 143 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 155 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.45 
 
 		 134 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 222 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 139 aa  49.7  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 229 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 146 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 124 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1761  phosphoglycerate mutase family protein  22.58 
 
 		 191 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  41.86 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3581  phosphoglycerate mutase family protein  22.58 
 
 		 191 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 		 195 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 		 153 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 		 175 aa  46.2  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 142 aa  45.8  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 180 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 161 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 138 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.01 
 
 		 583 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  34.88 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1822  phosphoglycerate mutase family protein  22.08 
 
 		 191 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.125465  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 149 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  35.34 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 138 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 229 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 134 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 167 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1755  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 161 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0638574  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 		 168 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 202 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 		 173 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 154 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 154 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.92 
 
 		 162 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  28.57 
 
 		 137 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 164 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 158 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 155 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 137 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 137 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2902  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 219 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00219034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 137 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>