More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2246 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  100 
 
 
168 aa  323  6e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  57.52 
 
 
182 aa  156  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  54.68 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  50.96 
 
 
337 aa  125  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  50 
 
 
152 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  46.85 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
145 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 
174 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
143 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
145 aa  91.3  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  38.69 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
146 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  42.06 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  39.77 
 
 
118 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  37.59 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  37.14 
 
 
149 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  36.88 
 
 
142 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  36.43 
 
 
149 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  36.43 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  36.43 
 
 
149 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  36.43 
 
 
149 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  32.03 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  36.43 
 
 
149 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 
149 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 
147 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 
147 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  36.43 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  32.06 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 
147 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  37.06 
 
 
334 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  39.1 
 
 
289 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  31.25 
 
 
137 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  36.04 
 
 
314 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  33.33 
 
 
134 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  40 
 
 
199 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  28.47 
 
 
159 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  27.21 
 
 
159 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  36.15 
 
 
153 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  40 
 
 
354 aa  52  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
157 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1522  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  31.13 
 
 
142 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 
306 aa  51.2  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
174 aa  50.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
155 aa  50.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1522  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
163 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467089  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  32.86 
 
 
336 aa  50.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0028  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  35 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  31.72 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  28.78 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
261 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1843  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  28.78 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  29.29 
 
 
128 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  39.77 
 
 
312 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  35 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
151 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2812  hypothetical protein  41.18 
 
 
75 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  31.93 
 
 
136 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  31.93 
 
 
136 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
156 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  39.08 
 
 
319 aa  48.9  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  31.93 
 
 
136 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  25.62 
 
 
140 aa  48.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
163 aa  47.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
303 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1070  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 
155 aa  47.8  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000247956  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 
157 aa  47.8  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
162 aa  47.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
154 aa  47.4  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
147 aa  47.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>