172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2398 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  100 
 
 
177 aa  353  6.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  60.93 
 
 
152 aa  175  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  57.79 
 
 
182 aa  167  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  57.24 
 
 
154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 
337 aa  155  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  54.68 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 
145 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
143 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
171 aa  98.6  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
147 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  46.62 
 
 
257 aa  91.3  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
145 aa  88.6  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 
182 aa  84.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
174 aa  84.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 
146 aa  84.3  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  44.04 
 
 
149 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  36.18 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1522  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1522  NUDIX hydrolase  43 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467089  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  41.54 
 
 
132 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  41.54 
 
 
132 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
132 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  39.72 
 
 
132 aa  58.2  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  34.78 
 
 
354 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  38.33 
 
 
142 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  38.33 
 
 
141 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
149 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  34.48 
 
 
118 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  35.16 
 
 
132 aa  52.4  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
147 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
153 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
140 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  32.76 
 
 
137 aa  52  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
149 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
152 aa  51.2  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
137 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
152 aa  51.2  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  38.3 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
133 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  36.13 
 
 
128 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  35.54 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  37.38 
 
 
314 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1843  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
162 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  36.27 
 
 
135 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  33.82 
 
 
347 aa  49.3  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
147 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
138 aa  48.9  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 
135 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  35.43 
 
 
138 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  36.36 
 
 
136 aa  48.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
133 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  35.29 
 
 
137 aa  48.5  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2812  hypothetical protein  36.51 
 
 
75 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
135 aa  48.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  29.06 
 
 
137 aa  48.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 
153 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.33 
 
 
135 aa  47.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  35.83 
 
 
149 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02760  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 
248 aa  47.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
138 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
137 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
148 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  35.83 
 
 
149 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  35.83 
 
 
149 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  35.83 
 
 
149 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  35.83 
 
 
149 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  31.91 
 
 
138 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
140 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  28.46 
 
 
134 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  26.79 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  31.93 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  34.31 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  36 
 
 
314 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  35.96 
 
 
138 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  25 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  35.96 
 
 
138 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  30.77 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  32.48 
 
 
136 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
334 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  36 
 
 
314 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  35.83 
 
 
334 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  32.33 
 
 
138 aa  45.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
148 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  35.83 
 
 
149 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
151 aa  45.1  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  27.5 
 
 
132 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.595719 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>