More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5523 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  100 
 
 
257 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 
147 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  53.47 
 
 
171 aa  158  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 
143 aa  155  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  49.29 
 
 
145 aa  148  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 
145 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 
145 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  58.88 
 
 
377 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  45.22 
 
 
157 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  43.15 
 
 
174 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
177 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  52.07 
 
 
146 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 
177 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  41.83 
 
 
156 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
182 aa  106  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  46.96 
 
 
149 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  47.71 
 
 
118 aa  98.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 
182 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  41.5 
 
 
337 aa  92.4  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
168 aa  90.1  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1752  hypothetical protein  55.79 
 
 
202 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
152 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 
151 aa  82  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  35.04 
 
 
154 aa  81.3  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  39.29 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  37.84 
 
 
137 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
135 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2608  hypothetical protein  45.16 
 
 
77 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  41.67 
 
 
314 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  41.67 
 
 
314 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2812  hypothetical protein  43.33 
 
 
75 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  37.82 
 
 
314 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  34.03 
 
 
386 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  30.61 
 
 
363 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  40.62 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  35.54 
 
 
316 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  41.12 
 
 
315 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
153 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
149 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  34.62 
 
 
400 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  33.83 
 
 
316 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  40.38 
 
 
142 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  32 
 
 
149 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  40.43 
 
 
141 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
140 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  33.61 
 
 
134 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  35.66 
 
 
329 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  31.51 
 
 
352 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  35.56 
 
 
136 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  34.62 
 
 
314 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  35.2 
 
 
136 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
170 aa  54.7  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.16 
 
 
131 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  29.86 
 
 
352 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
334 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  38.39 
 
 
147 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
184 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
132 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2619  hypothetical protein  62.86 
 
 
40 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
175 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  34.94 
 
 
137 aa  52.4  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  35.34 
 
 
321 aa  52.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  35.29 
 
 
313 aa  52.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
179 aa  52.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  37.11 
 
 
132 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  37.11 
 
 
132 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
299 aa  52  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
144 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
148 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 
165 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  35.83 
 
 
313 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.51 
 
 
134 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
140 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  31.78 
 
 
163 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  36.79 
 
 
136 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  25.81 
 
 
183 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  25.81 
 
 
183 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  36.79 
 
 
136 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  34.29 
 
 
383 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  33.88 
 
 
337 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
140 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  30.84 
 
 
128 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  25.81 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 
161 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  36.79 
 
 
136 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.85 
 
 
128 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  40 
 
 
149 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  40 
 
 
149 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1522  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
160 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  40 
 
 
149 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  40 
 
 
149 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  26.76 
 
 
139 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2822  hypothetical protein  52.63 
 
 
40 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  33.08 
 
 
315 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3549  ADP-ribose diphosphatase NudE  26.45 
 
 
183 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.85 
 
 
128 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.85 
 
 
128 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 
158 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>