230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2614 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 171 aa  355  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  79.59 
 
 		 147 aa  249  9.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  47.89 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  53.47 
 
 		 257 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  44.06 
 
 		 145 aa  127  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  44.06 
 
 		 145 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  41.92 
 
 		 174 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  47.79 
 
 		 118 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  43.92 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  42.47 
 
 		 337 aa  98.2  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  37.3 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  36.92 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2812  hypothetical protein  45.71 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 151 aa  72  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2608  hypothetical protein  42.11 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  36.84 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  37.3 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  33.63 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  37.62 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  38.54 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 329 aa  54.3  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  36.63 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  36.63 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  36.63 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  36.63 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  36.63 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  36.63 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3293  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  37.5 
 
 		 334 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2244  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000175605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  32.5 
 
 		 136 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0666  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  31.13 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49101  predicted protein  30.33 
 
 		 174 aa  50.8  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00569442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  36.63 
 
 		 149 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  32.5 
 
 		 136 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 147 aa  50.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 147 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  32.5 
 
 		 136 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  31.13 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0215  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0699  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  32.12 
 
 		 315 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  33.06 
 
 		 337 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2259  NUDIX hydrolase  26.89 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0690  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  28.07 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  28.07 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.07 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  28.07 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1786  MutT/nudix family protein  31.4 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.07 
 
 		 132 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.07 
 
 		 129 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4009  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  30.69 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 340 aa  48.5  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5046  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1522  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2685  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 149 aa  48.1  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 334 aa  48.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0592  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164112  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0618  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.977297  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3717  cytidyltransferase-like protein  38.37 
 
 		 355 aa  47.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4074  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.999235 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.07 
 
 		 131 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3425  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.70639  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2959  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 183 aa  47.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  27.19 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  28.7 
 
 		 312 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.07 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3785  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 209 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2822  hypothetical protein  55.26 
 
 		 40 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1265  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_93251  predicted protein  34.26 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>