More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1811 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 145 aa  299  8.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  47.55 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  44.06 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  45.99 
 
 		 174 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2812  hypothetical protein  71.43 
 
 		 75 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 145 aa  115  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2608  hypothetical protein  69.01 
 
 		 77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  43.66 
 
 		 257 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 168 aa  88.6  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  41.28 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  36.51 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  35.48 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  35.34 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 182 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2619  hypothetical protein  86.49 
 
 		 40 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3203  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2822  hypothetical protein  84.21 
 
 		 40 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  33.05 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  32.2 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  32.2 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  35.65 
 
 		 337 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  32.79 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  38.53 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2524  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.736999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  31.25 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 299 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  28.57 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0028  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  30.99 
 
 		 329 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  34.82 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  28.68 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  30.89 
 
 		 314 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  31.4 
 
 		 314 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  29 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  28.35 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  31.4 
 
 		 314 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  30.25 
 
 		 314 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1965  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 217 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.28 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  28.46 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  29 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  31.43 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  29 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  33.61 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  34.45 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  34.34 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  32.48 
 
 		 473 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  31.67 
 
 		 313 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  31.25 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  32 
 
 		 314 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  30.95 
 
 		 315 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.69 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  44.12 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  30.7 
 
 		 317 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  34.34 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  29.92 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  26.4 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  26.98 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  31.3 
 
 		 325 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.92 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.92 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.92 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  31.93 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>