21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2812 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2812  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  160  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2608  hypothetical protein  85.71 
 
 
77 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  71.43 
 
 
145 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  48.53 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  56.45 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  47.14 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  43.33 
 
 
257 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  38.67 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
182 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  41.51 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  59.38 
 
 
337 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>