More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2547 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 143 aa  297  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  80.71 
 
 		 145 aa  246  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 171 aa  148  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 		 147 aa  147  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  51.06 
 
 		 257 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  43.26 
 
 		 177 aa  118  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 174 aa  117  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  40.77 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 		 182 aa  94.4  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  37.4 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  38.89 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  38.31 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  38.1 
 
 		 337 aa  81.3  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2812  hypothetical protein  48.53 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2608  hypothetical protein  45.59 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  32.2 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  34.65 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  30.7 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  30.33 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  31.06 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  30 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  30.7 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 291 aa  53.9  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 158 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  30.37 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 334 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4458  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  34.55 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  31.62 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.59 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  32.04 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  29.36 
 
 		 329 aa  50.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  28.03 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.05 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  28.36 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  36.36 
 
 		 322 aa  50.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.45 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  31.82 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  28.03 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  28.57 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  28.57 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.57 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.57 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  28.81 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 199 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  27.83 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.26 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.43 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  26.96 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49101  predicted protein  29.71 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00569442  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.43 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.26 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1522  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3516  phosphohydrolase  33.33 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  26.56 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  29.66 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  29.91 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>