56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3844 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 152 aa  307  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  60.93 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  55.19 
 
 		 182 aa  149  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  50.33 
 
 		 154 aa  136  8.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  51.88 
 
 		 337 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 168 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 		 147 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  38.31 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  44.04 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  39.84 
 
 		 257 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1522  NUDIX hydrolase  44.21 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  32.2 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  30.3 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1522  NUDIX hydrolase  41 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467089  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24100  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  38.71 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2812  hypothetical protein  46.34 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  34.15 
 
 		 118 aa  43.9  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 281 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  38.04 
 
 		 570 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  33.91 
 
 		 305 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1041  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.317547  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0168  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.81 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 149 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  31.25 
 
 		 134 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2902  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00219034  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2608  hypothetical protein  47.37 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  25.42 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  29.55 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  34.15 
 
 		 354 aa  41.2  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  38.46 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3006  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  34.17 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 		 171 aa  40  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>