More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0545 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  70.85 
 
 		 200 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  68.69 
 
 		 204 aa  298  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 203 aa  293  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  64.43 
 
 		 203 aa  275  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  63.92 
 
 		 203 aa  274  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  65.98 
 
 		 204 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  63.78 
 
 		 200 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  63.92 
 
 		 203 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  63.92 
 
 		 200 aa  270  9e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  63.92 
 
 		 200 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  63.92 
 
 		 200 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  63.92 
 
 		 200 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  62.89 
 
 		 200 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  61.14 
 
 		 207 aa  256  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  60.53 
 
 		 208 aa  250  8.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  57.44 
 
 		 208 aa  238  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  56.41 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  56.41 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  56.41 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  56.41 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  56.92 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3776  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  55.33 
 
 		 211 aa  236  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  56.41 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  56.41 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  56.41 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  56.41 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3618  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  55.84 
 
 		 211 aa  235  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  55.9 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  55.38 
 
 		 210 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  55.38 
 
 		 210 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  55.38 
 
 		 210 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  55.38 
 
 		 210 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  55.38 
 
 		 210 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.82 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  53.03 
 
 		 216 aa  228  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.97 
 
 		 210 aa  227  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  54.08 
 
 		 216 aa  227  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  53.09 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  51.26 
 
 		 215 aa  218  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.02 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0655  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.08 
 
 		 210 aa  215  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0574  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.08 
 
 		 210 aa  215  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0283  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.08 
 
 		 210 aa  215  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0324  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  54.31 
 
 		 210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000684842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  51.38 
 
 		 188 aa  205  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  47.24 
 
 		 206 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  51.76 
 
 		 214 aa  197  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 209 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 205 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  44.85 
 
 		 199 aa  191  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 205 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0370  ADP-ribose pyrophosphatase  43.43 
 
 		 205 aa  184  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  46.32 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  45.55 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 206 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  45.55 
 
 		 205 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  47.15 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  47.03 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  47.03 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  44.21 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  46.7 
 
 		 194 aa  177  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1477  hypothetical protein  47.15 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  44.22 
 
 		 213 aa  174  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  43.78 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  41.97 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  45.55 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1358  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  42.02 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1992  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  38.69 
 
 		 375 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0818  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 362 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2315  NUDIX hydrolase  38.8 
 
 		 378 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 361 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  36.22 
 
 		 361 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 196 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3860  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 368 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.16 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  34.2 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 193 aa  94.7  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  31.05 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  31.49 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1775  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.48 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4209  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  31.49 
 
 		 193 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 191 aa  88.2  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  29.47 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2637  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 180 aa  86.3  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>