More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0495 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  78.54 
 
 		 215 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  78.54 
 
 		 205 aa  347  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  78.54 
 
 		 209 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  78.54 
 
 		 205 aa  345  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  77.56 
 
 		 205 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  73.66 
 
 		 205 aa  338  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  72.68 
 
 		 205 aa  313  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  73.71 
 
 		 199 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  74.15 
 
 		 205 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  74.15 
 
 		 205 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3776  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  52.85 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  50 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.81 
 
 		 210 aa  197  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.03 
 
 		 210 aa  197  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  50.26 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3618  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.3 
 
 		 211 aa  194  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  51.81 
 
 		 213 aa  194  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  48.97 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  48.97 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.97 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.97 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  48.97 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.97 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.97 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.97 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.97 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  48.7 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  49.48 
 
 		 208 aa  192  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  45.1 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  52.15 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.7 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.7 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.7 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.7 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.7 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  49.48 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  50.77 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  48.17 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  47.64 
 
 		 200 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  48.97 
 
 		 201 aa  184  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  47.64 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  47.64 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  47.64 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  47.64 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  48.17 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  48.68 
 
 		 203 aa  181  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  47.12 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  45.55 
 
 		 202 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0324  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  52.33 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000684842  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  47.62 
 
 		 200 aa  177  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  48.11 
 
 		 204 aa  177  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0574  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.26 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0283  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.26 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0655  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.26 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  47.4 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  45.95 
 
 		 200 aa  175  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  43.59 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  47.31 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  48.96 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  42.39 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1477  hypothetical protein  49.21 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  47.45 
 
 		 210 aa  171  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  43.94 
 
 		 361 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  48.07 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  45.08 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  43.43 
 
 		 361 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0818  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 		 362 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0370  ADP-ribose pyrophosphatase  40.86 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2315  NUDIX hydrolase  42.56 
 
 		 378 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1358  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  40.39 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1992  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.24 
 
 		 375 aa  128  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  36.41 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3860  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 368 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2637  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4209  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.16 
 
 		 194 aa  98.2  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3722  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  38.41 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  37.91 
 
 		 193 aa  91.7  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1775  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.85 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  33.77 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  34.44 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  34.44 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  34.44 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  34.44 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  34.44 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>