More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5218 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  39.33 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  38.98 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  34.43 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.75 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.33 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  33.33 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.79 
 
 		 208 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  35.8 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  32.8 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0370  ADP-ribose pyrophosphatase  34.86 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  33.9 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 193 aa  101  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  31.89 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  34.24 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  32.09 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 180 aa  98.6  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.68 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  33.14 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.05 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  33.89 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  32.77 
 
 		 215 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  33.33 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  33.89 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  36.91 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  33.89 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  33.15 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  33.15 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.02 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  34.22 
 
 		 335 aa  95.5  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 		 193 aa  95.1  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  28.26 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  31.89 
 
 		 209 aa  94.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.81 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 205 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  31.64 
 
 		 210 aa  94.4  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.68 
 
 		 203 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.35 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  39.6 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  32.4 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.43 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.4 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.4 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  28.57 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  30.27 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  32.2 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  32.2 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.2 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.2 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.2 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  32.2 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  35.95 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  36.3 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.2 
 
 		 209 aa  91.3  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.2 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.2 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 		 206 aa  90.9  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.11 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  30.11 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  30.6 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.98 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  30.22 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  30.11 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.39 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  28.57 
 
 		 215 aa  88.6  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  32.68 
 
 		 191 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  34.15 
 
 		 176 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  27.87 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  27.87 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>