252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004521 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  87.04 
 
 		 216 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  74.88 
 
 		 208 aa  329  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  60.98 
 
 		 215 aa  267  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.13 
 
 		 210 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.13 
 
 		 210 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.13 
 
 		 210 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.13 
 
 		 210 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.13 
 
 		 210 aa  261  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.13 
 
 		 210 aa  260  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  58.37 
 
 		 209 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  58.37 
 
 		 209 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  58.37 
 
 		 209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  58.37 
 
 		 209 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  58.37 
 
 		 209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  58.37 
 
 		 209 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  58.37 
 
 		 209 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  58.37 
 
 		 209 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  58.37 
 
 		 209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  57.87 
 
 		 204 aa  250  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.6 
 
 		 210 aa  246  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3618  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  56.73 
 
 		 211 aa  247  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  58.38 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3776  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  56.25 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0655  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  60.1 
 
 		 210 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0574  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  60.1 
 
 		 210 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0283  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  60.1 
 
 		 210 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  54.04 
 
 		 206 aa  234  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  54.55 
 
 		 200 aa  228  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  53.03 
 
 		 202 aa  228  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0324  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.09 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000684842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  52.5 
 
 		 203 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  54.12 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  53.3 
 
 		 204 aa  222  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  50.49 
 
 		 208 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  50 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  50.81 
 
 		 188 aa  210  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 200 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 200 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 200 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 200 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  50 
 
 		 203 aa  205  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  49.48 
 
 		 203 aa  203  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  50 
 
 		 203 aa  203  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  47.45 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  48.45 
 
 		 200 aa  201  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  49.48 
 
 		 200 aa  201  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  50 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  50 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  48.96 
 
 		 196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  48.7 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  48.96 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  47.92 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  47.4 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  48.97 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  48.97 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  43.65 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0370  ADP-ribose pyrophosphatase  40.61 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  44.28 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 206 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  44.51 
 
 		 194 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1477  hypothetical protein  43.15 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.38 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  40.93 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 361 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  35.9 
 
 		 361 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0818  NUDIX hydrolase  34.8 
 
 		 362 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1358  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  38.1 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2315  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 378 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3860  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 368 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1992  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.83 
 
 		 375 aa  120  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  34.18 
 
 		 236 aa  99.4  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 194 aa  98.6  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 197 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 191 aa  98.2  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  33.33 
 
 		 191 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  33.33 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  31.77 
 
 		 191 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  31.77 
 
 		 191 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  31.77 
 
 		 191 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  31.77 
 
 		 191 aa  95.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4209  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 193 aa  94.7  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>