More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3331 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  64.5 
 
 		 200 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  64.5 
 
 		 200 aa  268  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  64.5 
 
 		 200 aa  268  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  64.5 
 
 		 200 aa  268  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  65.31 
 
 		 203 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  65.31 
 
 		 203 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  66.31 
 
 		 203 aa  265  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  58.82 
 
 		 207 aa  264  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  64.29 
 
 		 203 aa  264  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  64.58 
 
 		 200 aa  263  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  63 
 
 		 200 aa  260  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  60.53 
 
 		 202 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  57.28 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  59.36 
 
 		 204 aa  248  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  62.23 
 
 		 200 aa  248  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  62.57 
 
 		 204 aa  247  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  60 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  58.21 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3776  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  61.05 
 
 		 211 aa  245  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3618  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.5 
 
 		 211 aa  244  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  58.25 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  58.25 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  58.25 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  58.25 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  59.79 
 
 		 209 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  59.79 
 
 		 209 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.79 
 
 		 209 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.79 
 
 		 209 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.79 
 
 		 209 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  59.79 
 
 		 209 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.79 
 
 		 209 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.79 
 
 		 209 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  58.25 
 
 		 210 aa  240  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  59.26 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  54.85 
 
 		 206 aa  237  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0655  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  57.35 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0574  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  57.35 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0283  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  57.35 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0324  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  60 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000684842  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  52.22 
 
 		 216 aa  223  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  55.22 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  56.35 
 
 		 188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  50.49 
 
 		 216 aa  217  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  51.22 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  51.71 
 
 		 206 aa  206  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  51.03 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  51.03 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  50.52 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  50.52 
 
 		 205 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  51.22 
 
 		 215 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  51.6 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  50 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  51.01 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  49.74 
 
 		 201 aa  195  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  50.75 
 
 		 214 aa  194  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  49.74 
 
 		 196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  46.28 
 
 		 205 aa  185  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  47.87 
 
 		 194 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  49.27 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  49.27 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  45.03 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0370  ADP-ribose pyrophosphatase  42.55 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 		 204 aa  171  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1477  hypothetical protein  46.84 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  45.6 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  42.86 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0818  NUDIX hydrolase  39.9 
 
 		 362 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  38.95 
 
 		 361 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 		 361 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1358  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  39.11 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 201 aa  127  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2315  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 		 378 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1992  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.1 
 
 		 375 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3860  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 368 aa  118  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.5 
 
 		 194 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1775  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.5 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4209  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3722  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.26 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 195 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 194 aa  91.7  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  34.27 
 
 		 192 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  27.57 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2637  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  30.77 
 
 		 193 aa  88.6  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  27.55 
 
 		 193 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  31.38 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  30.27 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>