More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3294 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  100 
 
 
194 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  86.32 
 
 
191 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  84.46 
 
 
193 aa  347  4e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  79.06 
 
 
193 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  77.01 
 
 
191 aa  313  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  67.03 
 
 
191 aa  269  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.819816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  67.03 
 
 
191 aa  269  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  67.03 
 
 
191 aa  269  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  67.03 
 
 
191 aa  269  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  67.03 
 
 
191 aa  269  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  67.03 
 
 
191 aa  269  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  67.03 
 
 
191 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  67.03 
 
 
191 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  66.31 
 
 
191 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  64.4 
 
 
191 aa  263  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  64.86 
 
 
191 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  64.86 
 
 
191 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  64.86 
 
 
191 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  73.26 
 
 
198 aa  262  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  73.26 
 
 
198 aa  262  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  73.26 
 
 
198 aa  262  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  64.86 
 
 
191 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  64.32 
 
 
191 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  61.26 
 
 
195 aa  245  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  62.96 
 
 
193 aa  244  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  56.99 
 
 
193 aa  230  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  58.6 
 
 
194 aa  228  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  58.24 
 
 
196 aa  227  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  61.08 
 
 
195 aa  223  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  55.03 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  58.6 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  58.6 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  58.6 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  58.6 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  57.84 
 
 
199 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  59.46 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  59.89 
 
 
198 aa  218  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  57.84 
 
 
199 aa  208  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  56.76 
 
 
199 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  56.76 
 
 
199 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  56.76 
 
 
199 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  57.61 
 
 
201 aa  208  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  56.22 
 
 
201 aa  205  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  58.92 
 
 
198 aa  204  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  53.26 
 
 
199 aa  202  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  55.14 
 
 
200 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  55.14 
 
 
195 aa  202  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  54.59 
 
 
202 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  57.45 
 
 
196 aa  194  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  50.53 
 
 
193 aa  187  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  50.81 
 
 
236 aa  184  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  47.4 
 
 
335 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 
198 aa  175  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  48.11 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  49.73 
 
 
197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  48.11 
 
 
196 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
198 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  42.71 
 
 
192 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  49.72 
 
 
201 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  44.33 
 
 
193 aa  158  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 
209 aa  155  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
204 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  37.63 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
199 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  34.22 
 
 
201 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
188 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 
188 aa  101  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  33.87 
 
 
204 aa  101  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 
188 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  34.92 
 
 
216 aa  98.6  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  33.33 
 
 
200 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  31.72 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.51 
 
 
210 aa  95.9  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
195 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.28 
 
 
206 aa  94.4  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.8 
 
 
203 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.8 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.8 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.33 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
200 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
200 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
200 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
200 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
203 aa  91.7  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.75 
 
 
208 aa  91.7  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  33.87 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  33.86 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.96 
 
 
210 aa  88.2  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.41 
 
 
201 aa  88.2  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.18 
 
 
207 aa  87.8  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.53 
 
 
209 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.53 
 
 
209 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  30.53 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.53 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  30.53 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.53 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.53 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>