More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5997 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 199 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  77.25 
 
 		 204 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  62.9 
 
 		 188 aa  218  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  61.18 
 
 		 188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  61.18 
 
 		 188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  57.75 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5441  NUDIX hydrolase  56.42 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0514  NUDIX hydrolase  54.89 
 
 		 189 aa  167  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222532  hitchhiker  0.000757753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0688  NUDIX hydrolase  51.09 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  normal  0.751646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  42.71 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 193 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  38.17 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  45.75 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  33.85 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  37.04 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  35.58 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  35.8 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  35.8 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  35.8 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  37.44 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  38.26 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  35.8 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  34.57 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  34.57 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  34.57 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  34.57 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  35.8 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  35.79 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  37.58 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  37.58 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  37.58 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  37.58 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  38.74 
 
 		 209 aa  104  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 195 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  36.41 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 178 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.9 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.46 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  31.35 
 
 		 194 aa  97.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.9 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.9 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 177 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  31.58 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  33.53 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  38.2 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  33.51 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.6 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  35.8 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  35.8 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.41 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.41 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>