More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1203 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  98.95 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  98.95 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  98.43 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  97.91 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  87.43 
 
 		 191 aa  354  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  87.43 
 
 		 191 aa  354  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  87.43 
 
 		 191 aa  354  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  86.91 
 
 		 191 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  86.91 
 
 		 191 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  82.11 
 
 		 191 aa  330  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  64.4 
 
 		 191 aa  271  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  67.03 
 
 		 194 aa  269  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  66.12 
 
 		 191 aa  258  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  65.03 
 
 		 193 aa  256  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  62.84 
 
 		 193 aa  247  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  53.97 
 
 		 195 aa  228  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  57.07 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  54.69 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  61.08 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  61.08 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  61.08 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  51.6 
 
 		 196 aa  211  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  54.19 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  55.74 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  55.74 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  55.74 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  55.74 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 199 aa  207  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  53.16 
 
 		 198 aa  204  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  54.4 
 
 		 195 aa  200  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  53.23 
 
 		 195 aa  197  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  49.74 
 
 		 194 aa  197  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  48.95 
 
 		 199 aa  194  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  49.46 
 
 		 199 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  49.46 
 
 		 199 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  49.46 
 
 		 199 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.37 
 
 		 199 aa  191  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  51.91 
 
 		 201 aa  190  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  49.73 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  54.29 
 
 		 195 aa  187  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  52.6 
 
 		 202 aa  185  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  51.05 
 
 		 198 aa  185  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  52.78 
 
 		 236 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  48.97 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  47.03 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  49.21 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  48.62 
 
 		 335 aa  164  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  42.19 
 
 		 192 aa  164  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  45.81 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  42.71 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  41.21 
 
 		 194 aa  154  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  48.59 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 188 aa  101  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 188 aa  100  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 201 aa  98.2  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 216 aa  96.3  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5441  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 191 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  29.26 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1358  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.22 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.67 
 
 		 206 aa  92.8  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.32 
 
 		 206 aa  91.3  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  35.57 
 
 		 208 aa  88.2  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  31.89 
 
 		 210 aa  88.2  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  36.42 
 
 		 215 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  34.18 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.33 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.33 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.33 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.33 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.44 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  31.61 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  33.54 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  33.54 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  34.05 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.7 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 199 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  31.22 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  27.98 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  35.71 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.12 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.12 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  32.68 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.03 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  34.23 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.03 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>