More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0608 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  78.57 
 
 		 205 aa  327  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  77.32 
 
 		 209 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  77.32 
 
 		 205 aa  318  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  76.29 
 
 		 205 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  76.29 
 
 		 205 aa  314  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  82.05 
 
 		 205 aa  309  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  82.05 
 
 		 205 aa  309  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  72.16 
 
 		 215 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  73.71 
 
 		 205 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  69.07 
 
 		 205 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3776  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  52.53 
 
 		 211 aa  214  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.76 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  50.75 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.25 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.25 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.25 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.25 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  49.75 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  49.75 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  49.75 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  49.75 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  49.75 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  49.75 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  49.75 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  49.75 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.25 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  49.75 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3618  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.02 
 
 		 211 aa  208  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  54.12 
 
 		 213 aa  208  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.25 
 
 		 210 aa  207  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.53 
 
 		 210 aa  206  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  48.99 
 
 		 216 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  47.45 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  50.79 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  51.02 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  50 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.79 
 
 		 201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  52.31 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0655  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.53 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0283  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.53 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0574  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.53 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  44.85 
 
 		 202 aa  191  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  47.92 
 
 		 214 aa  191  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  44.95 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  45.73 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  48.17 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 		 196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0324  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  52.55 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000684842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  48.92 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  45.92 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  44.85 
 
 		 203 aa  185  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  45.36 
 
 		 203 aa  184  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  45.03 
 
 		 203 aa  184  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0370  ADP-ribose pyrophosphatase  42.78 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  45.36 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  44.85 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  45.36 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  45.36 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  45.36 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  44.02 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  44.85 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  49.23 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  46.07 
 
 		 200 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  50.28 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  45.79 
 
 		 200 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  47.98 
 
 		 210 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1477  hypothetical protein  46.6 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  44.21 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 		 361 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  40.72 
 
 		 361 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0818  NUDIX hydrolase  41.97 
 
 		 362 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1358  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  40.62 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2315  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 378 aa  134  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1992  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.56 
 
 		 375 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3860  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 		 368 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4209  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146155  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  39.87 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3722  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.57 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  34.24 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2637  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 217 aa  94.4  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1775  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.16 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 199 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  42.66 
 
 		 188 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  32.95 
 
 		 192 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  42.66 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.66 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.66 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 209 aa  88.2  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  32.9 
 
 		 198 aa  88.2  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>